Depuis 1992, des structures et individus impliqués dans l’Education à l’Environnement (EE) en Franche-Comté et en Suisse romande se sont constitués en réseau - le Réseau franco-suisse d’EE - afin de développer une coopération transfrontalière en matière d’EE.
 
Dès 1997, conscients du besoin de structurer ce réseau, d’intensifier leur collaboration et leurs activités, les membres du Comité de pilotage ont préparé puis soumis un projet Interreg II aux autorités régionales compétentes et obtenu leur soutien financier à l’automne 1998.